Aunque es posible crear un virus para sistemas con GNU/Linux, el diseño del sistema hace muy difícil que este logre infectarse. Un usuario local podría causar daño corriendo algún virus en sus sistemas, sin embargo esto es un caso muy aislado y no algo que se podría salir de control y expandirse a otros sistemas (como sucede en Windows).
Además, prácticamente todos los distribuidores de anti-virus para Linux hasta ahora ofrecen actualizaciones en línea gratuitas. Lo que sí es verdad, es que pertenecer a la comunidad Open Source, simplemente no tiene precio.
También, cada distribución de Linux viene con varias aplicaciones incluidas. Cualquier tipo de software que estés buscando como puede ser Mensajería Instantánea, herramientas de backups, procesadores de texto, diseño grafico/web, software para programación, etc. seguramente esta incluido en tu distribución de Linux.
Linux ofrece total libertad de decisión. Se puede elegir entre miles de programas para solucionar de la mejor manera nuestros problemas informáticos. Por ejemplo, tres conocidos procesadores de texto se encuentran disponibles. Los tres son libres y compatibles con Microsoft Word, pero cada uno ofrece ventajas y desventajas. Lo mismo para los navegadores.
GNU/Linux por si mismo y muchas aplicaciones siguen los estándares abiertos. Esto significa que una actualización en un sistema no hará obsoletos otros sistemas.
Por último, cada vez más computadoras se conectan a Internet. Ningún sistema estaría completo si no incluye herramientas para permitir la interoperabilidad con computadoras corriendo otros sistemas operativos. Una vez más, Linux es muy firme en esta área, incluye Samba, un software que permite que Linux haga de cliente en una red sobre Microsoft Windows. De hecho, Samba incluye facilidades para correr tu Linux como servidor de una red con clientes Linux y Windows.
Al mismo tiempo, GNU/Linux incluye software para conectarse a redes Apple y Novells Netware. NFS, la tecnología de "Networking" desarrollada por UNIX también esta incluida en el sistema.
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